Dr. H. Muhammad Noor, M.Si menempuh pendidikan dasar dan menengah di Tanah Grogot yaitu SD Negeri Tanah Grogot (lulus 1974), SMP Negeri 1 Tanah Grogot (lulus 1977), dan SMA Negeri 1 Tanah Grogot (lulus 1980). Melanjutkan pendidikan S1 di Samarinda pada Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik Universitas Mulawarman tahun 1985 dan Pasca Sarjananya diselesaikan di Universitas Padjadjaran tahun 1994 serta melanjutkan program doktoral tahun 1995 di Universitas Padjadjaran dan menyelesaikan doktoral di Universitas 17 Agustus 1945 Surabaya tahun 2015.